В каких случаях нужно использовать переходник в MT-Box?
 

В MT-Box для Nokia в комплекте кабелей есть переходник.
В каких случаях и с какими кабелями надо его применять?

В подавляющем большенстве случаев!
Просто смотри на коннекторы своих кабелей.
Если они 8-ми пиновые - только через переходник!

А те что для JAF (7-ми пиновые) ,тоже тогда через переходник?

У меня нет JAF, по этому я не совсем понимаю как кабели могут быть с 7-ми пиновым коннектором.
В стандартах RG нет 7-ми пинового коннектора, на сколько я знаю.
Тем не менее, если у них распин совпадает с UFS, то ответ "ДА", можно, и тоже через переходник!

У MT-Box разъем для подключения кабелей 10P10C. У UFS, JAF и так далее 8P8C. Соответственно, применять переходник надо во всех случаях, в которых вы используете с MT-Box кабели для UFS или JAF независимо от количества пинов на кабеле. 7-пиновые кабели названы так не потому, что у них вместо RJ45 вилки 7-контактный разъем, а потому, что контакт с телефоном производится через 7 пинов.